Большинство музеев-кораблей РФ - военные корабли, боевой путь которых связан с событиями мировых войн и революций, их профиль можно определить как военно-исторический или историко-революционный. Однако любой корабль представляет для посетителей интерес своей инженерно-технической стороной и должен считаться также научно-техническим музеем. Особенность музеефикации кораблей заключается в том, что подготовка судна (особенно подводной лодки) к экспозиционному показу (см. экспозиционная деятельность) и приему посетителей требует сложных технических работ, которые часто должны проводиться на корабельных заводах. В случае, если корабль экспонируется на воде (как это имеет место в Калининграде) возникают сложности и при его эксплуатации. Сегодня сформировались основные принципы музеефикации кораблей, когда часть помещений остаются в неприкосновенном виде или оборудуются ансамблевыми экспозициями (каюты, торпедные отсеки, камбуз, научно-исследовательские лаборатории и т.д.), дающими представление о техническом устройстве корабля и жизни его экипажа, а часть переоборудуется под исторические и тематические экспозиции. Среди экспозиционных приемов на кораблях-музеях широко используются аудиосистемы с записями шума моря, звуков торпедной атаки и т.п.

Крейсер "Аврора" (С.-Петербург) Филиал Центрального военно-морского музея

"Витязь", Музей Мирового океана, Калининград

"Космонавт Пацаев", Музей Мирового океана, Калининград

Ледокол "Красин", С. Петербург

"Д-2" ("Народоволец"), подводная лодка, С. Петербург

Святитель Николай, пароход, Красноярск

"Красный вымпел", мемориальный сторожевой корабль, филиал Музея Тихоокеанского флота, Владивосток

"С-56", гвардейская краснознаменная подводная лодка, филиал Музея Тихоокеанского флота, Владивосток

К-21, краснознаменная подводная лодка (1983), филиал музея Северного флота в г. Североморск

Шхуна "Запад" в составе Музея поморского мореплавания в г. Архангельск

Первые попытки сохранения кораблей в качестве мемориальных объектов были предприняты при Петре I. В 1723 г. император издал указ о сохранении остатков переяславской флотилии, а в 1803 г. на деньги, собранные владимирским дворянством, было построено на берегу Переславского озера здание музея для сохранения петровского бота "Фортуна". В Астрахани с конца 18 до середины 20 в. сохраняли в специальном здании галеру "Тверь", на которой путешествовала по Волге Екатерина II.

Первым кораблем-музеем стал легендарный крейсер "Аврора", участвовавший в русско-японской, Первой мировой и Великой отечественной войнах, корабль №1 в списках кораблей Военно-морского флота России, с борта которого 25 октября 1917 г. был произведен выстрел, послуживший сигналом к штурму Зимнего дворца. В 1948 г. поставлен на вечную стоянку у Петроградской набережной в С.-Петербурге. Экспонируется как мемориальное судно и уникальный памятник кораблестроения. В 1958 г. был открыт для посетителей поставленный на вечную стоянку в бухте "Золотой рог" старейший корабль Тихоокеанского флота "Красный вымпел". В 1980-90-е гг. были музеефицированы подводные лодки: во Владивостоке, Калининграде, Северодвинске и Санкт-Петербурге. Во 2-й половине 1990-х гг. крупным центром, осуществляющим деятельность по сохранению и музеефикации кораблей, стал Музей Мирового океана в г. Калининград. Здесь сформировалась музейная набережная исторического флота (наб. им. Петра Великого), у которой на р. Перголе поставлены на вечную стоянку знаменитое научно-исследовательское судно "Витязь", боевая подводная лодка Б-413, корабль космической флотилии "Космонавт Пацаев". Особенно разнообразная и яркая экспозиция создана на "Витязе", она посвящена как истории самого корабля и совершенных на нем научных открытий, так и различным аспектам взаимоотношений человека и мирового океана.