"Сердцем" любого музея называют его фонды. С момента основания Заповедника в 1984 году музейные коллекции увеличивались год от года и сейчас насчитывают свыше 30 тысяч единиц хранения. Это материальные и документальные памятники истории города Симбирска XIX - XX вв. Документальные фонды хранят архивы наших известных земляков (И.Я.Яковлева, Ф.О.Ливчака, Ф.Е.Вольсова и др.), материалы по образованию в Симбирске, истории, архитектуре, развитию торговли, науки, ремёсел и др.

В фондах хранится свыше 2 тысяч фотографий с видами нашего города в XIX в. Уникальные коллекции керамики и стекла (столовые сервизы, вазы, статуэтки, шкатулки, изготовленные мастерами известных российских фабрик и европейских фирм); богатая коллекция металла (физические приборы, собрания инструментов, машин для ремесел, станков, осветительных приборов); коллекция дерева (мебель ХIХ в., сундуки, резные фигурки). Более тысячи единиц хранения насчитывает коллекция тканей (национальные костюмы народов, населяющих Симбирскую губернию, вечерние платья баронесс, костюмы купчих, вышивка шелком, бисером, кружево). Особый интерес вызывает коллекция раритетных музыкальных инструментов и изобразительных материалов (графика и живопись симбирских-ульяновских художников).

Это первое фондохранилище в Ульяновской области, общей площадью 408 кв. м. Музейные коллекции разместились на 2х этажах и в специально оборудованном подвале. Планируется оснастить фонды самым современным оборудованием, отвечающим всем требованиям сохранности музейных предметов. Новое здание фондохранилища выполнено в традициях архитектуры Симбирска. Оно гармонирует не только с соседними зданиями, но придает колорит всей улице.