Музей был основан в 1907 году при Московских Высших женских курсах преподавателем кафедры эволюции и дарвинизма Александром Федоровичем Котсом. К 1913 г. коллекция насчитывала несколько тысяч экземпляров и была подарена А.Ф. Котсом Высшим женским курсам.

История музея полна как радостными, так и печальными событиями. Красной линией проходит через неё постоянная борьба за собственное здание. А.Ф. Котс и директора, принявшие после него эстафету забот о музее, в течение многих десятилетий писали письма и обивали пороги учреждений, обращались за поддержкой к научной общественности, чтобы доказать нужность и важность музея, ценность его коллекций.

Только на 87 году своего существования музей получил собственное здание, которое строилось 20 лет. 2 сентября 1995 года Мэр Москвы Юрий Михайлович Лужков торжественно открыл первые экспозиционные залы в новом доме. Сбылась мечта А.Ф. Котса: «Пройдут года. Наш Дарвиновский музей дождется своих стен, достойных содержания его. Раскроются перед десятками миллионов изумленных зрителей скрытые пока за недостатком места уникальные коллекции музея».

15 лет прошло со дня открытия экспозиции в новом здании. Казалось бы, обычная дата, но для Дарвиновского музея, столько раз находившегося на грани уничтожения, это значимое событие. Специально к этой дате мы подготовили интересную и насыщенную программу для посетителей. В этот день каждый купивший билет в музей сможет стать участником беспроигрышной лотереи и получить на память о празднике небольшие сувениры от музея и его партнёров.

Экспозиция музея ежегодно модернизируется. О самых значительных изменениях, происшедших с момента её открытия расскажет фотовыставка «Живая экспозиция» (Ещё один вариант названия «Эволюция музея эволюции», или «Эволюция музея») в зале «Многообразие жизни на Земле». Одна из самых красивых витрин этого зала «Тропический лес» сейчас реконструируется, и процесс создания новой экспозиции можно будет увидеть с галереи 2-го этажа.

Для юных посетителей музея мы подготовили путевой листок «Музей раскрывает секреты». Он поможет самостоятельно познакомиться с экспозицией музея и её наиболее интересными экспонатами. Самые внимательные и любознательные путешественники, выполнившие все задания путевого листка, получат в награду «Удостоверение музейного знатока».

Свои автографы, рисунки, поздравления и пожелания музею, впечатления о посещении музея участники праздника смогут оставить на «Стене впечатлений».